Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ61

C19orf43, Uncharacterized protein C19orf43, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf43Q9BQ61 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf43Q9BQ61 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms