Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms