Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms