Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
STAMBPL1Q96FJ0 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms