Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms