Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCE1Q969G3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms