Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP13Q92995 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP13Q92995 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
USP13Q92995 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
USP13Q92995 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
USP13Q92995 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
USP13Q92995 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP13Q92995 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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