Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 RBM33-207ENST00000401878 10149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 BCL9-201ENST00000234739 6278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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COPS9Q8WXC6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AL109976.1-201ENST00000621919 5678 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 BTBD9-201ENST00000314100 8486 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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