Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms