Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms