Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYT2Q8N9I0 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.7 ms