Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RNF148Q8N7C7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RNF148Q8N7C7 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RNF148Q8N7C7 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RNF148Q8N7C7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RNF148Q8N7C7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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