Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDCD3Q8IVD9 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms