Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NLRP13Q86W25 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP13Q86W25 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms