Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms