Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAD11Q709F0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms