Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms