Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms