Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 RUNX1T1-227ENST00000520724 2103 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 TK2-206ENST00000527800 2687 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 HMGB1-206ENST00000405805 4199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 CNOT4-203ENST00000361528 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 NFASC-202ENST00000360049 10120 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 NFASC-225ENST00000539706 10135 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 LVRN-201ENST00000357872 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAMTS20-201ENST00000389420 6076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC26A4-201ENST00000265715 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 BCL9-201ENST00000234739 6278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 AL713866.1-201ENST00000563320 3125 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 EIF3C-209ENST00000566501 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 SMARCE1-202ENST00000348513 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 CAMK4-201ENST00000282356 12240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC25A5-AS1-203ENST00000446986 1874 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF130-207ENST00000522208 9945 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 NTRK2-208ENST00000395882 7111 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 EPHB6-202ENST00000422643 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP25-1Q3LHN0 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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