Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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