Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CTF1Q16619 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CTF1Q16619 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CTF1Q16619 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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CTF1Q16619 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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CTF1Q16619 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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CTF1Q16619 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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CTF1Q16619 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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CTF1Q16619 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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