Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms