Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms