Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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SSX1Q16384 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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SSX1Q16384 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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SSX1Q16384 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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SSX1Q16384 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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SSX1Q16384 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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SSX1Q16384 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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SSX1Q16384 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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