Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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