Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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GRIK4Q16099 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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GRIK4Q16099 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK4Q16099 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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