Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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