Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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ITSN1Q15811 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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