Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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EFNB3Q15768 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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EFNB3Q15768 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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EFNB3Q15768 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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EFNB3Q15768 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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EFNB3Q15768 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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EFNB3Q15768 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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EFNB3Q15768 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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EFNB3Q15768 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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EFNB3Q15768 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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EFNB3Q15768 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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