Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TAF13Q15543 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms