Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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