Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRKQ15262 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
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