Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
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R3HDM1Q15032 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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R3HDM1Q15032 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
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