Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SLC10A1Q14973 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms