Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EBI3Q14213 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms