Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms