Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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