Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms