Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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CUL4AQ13619 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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CUL4AQ13619 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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CUL4AQ13619 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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CUL4AQ13619 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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CUL4AQ13619 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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CUL4AQ13619 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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CUL4AQ13619 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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CUL4AQ13619 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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CUL4AQ13619 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
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