Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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