Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NAE1Q13564 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms