Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RLFQ13129 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RLFQ13129 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RLFQ13129 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RLFQ13129 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RLFQ13129 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RLFQ13129 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RLFQ13129 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RLFQ13129 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RLFQ13129 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RLFQ13129 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RLFQ13129 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RLFQ13129 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RLFQ13129 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RLFQ13129 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RLFQ13129 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RLFQ13129 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RLFQ13129 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RLFQ13129 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RLFQ13129 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RLFQ13129 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RLFQ13129 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RLFQ13129 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RLFQ13129 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RLFQ13129 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RLFQ13129 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RLFQ13129 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RLFQ13129 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RLFQ13129 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RLFQ13129 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RLFQ13129 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RLFQ13129 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RLFQ13129 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RLFQ13129 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RLFQ13129 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RLFQ13129 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RLFQ13129 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RLFQ13129 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RLFQ13129 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RLFQ13129 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RLFQ13129 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RLFQ13129 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RLFQ13129 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RLFQ13129 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RLFQ13129 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RLFQ13129 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RLFQ13129 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RLFQ13129 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RLFQ13129 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RLFQ13129 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RLFQ13129 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RLFQ13129 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RLFQ13129 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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