Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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FOXD4Q12950 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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FOXD4Q12950 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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