Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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KCNMA1Q12791 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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KCNMA1Q12791 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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KCNMA1Q12791 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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KCNMA1Q12791 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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KCNMA1Q12791 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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KCNMA1Q12791 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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KCNMA1Q12791 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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KCNMA1Q12791 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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KCNMA1Q12791 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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KCNMA1Q12791 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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KCNMA1Q12791 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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KCNMA1Q12791 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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KCNMA1Q12791 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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KCNMA1Q12791 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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KCNMA1Q12791 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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