Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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AP1B1Q10567 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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AP1B1Q10567 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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AP1B1Q10567 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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AP1B1Q10567 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1B1Q10567 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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