Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC173Q0VFZ6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms