Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms