Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms