Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms