Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms